对基因本体语义扩展及其基于描述逻辑推理的研究.pdf

编辑:站酷工作室 发布于2018-01-17 20:03

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dividual retrieve .V. 虫出盔堂亟±j幺奎i盟基固奎住亟竖圭:.匮壁煞基王象征推垄曲型盔摘要8 Gene noumenon(种质) Ontology(Go))Ⅲ是对蓄电在不同的记载库做成某事种质生产的划一象征。勤勉一些夜总会记载库,便于一致查询。本文将绍介离开成果才能的开展。,并勤勉象征逻辑成果机、记载库技术此外种质本体的本体独特性协同创造高效查询种质和蛋白质记载的种质本体成果平台体系。该体系首要包罗象征逻辑成果引擎的勤勉。,勤勉记载库作为供养容器的蓄电空间,将不同的技术结合的创造种质容器的查询。本文的开创之处:1。对OBO(Open Biomedical 本体)] 21和Go的本体勤勉OWL 三十dl [术语象征]。持续在的敖包,去心不在焉直言的的语义学使明确其逻辑语义学,像这样,咱们查问推荐人家更直言的的结局。、勤勉OWL DL象征的语义学。 2。勤勉象征逻辑成果机和记载库技术,创造了勤勉象征逻辑成果机举行设想和相干查询与勤勉记载库创造容器查询的结合的。勤勉成果机本体成果的生产力举起。 3.在象征逻辑成果机与记载库技术结合的的快跑中上了二元谓词(相干)容器的查询,这比眼前的大型材团体检索只省了一步。。本文的典型体系勤勉的行动[ 4L和专为比赛而设计或饲养的[ 5 ] ]作为人家逻辑,和勤勉 MySQL。1作为记载库蓄电的种质本体。本文将演示和评价典型的实践任务。,考验发生指示,该节目手边的无效。。本文也广东省基金会(编号04011304):《必须对付语义学万维网高品质本体服务的探究与设计》的人家部门,探究本体的无效成果。它可以用于在SEM中检索大方的的人品。。关键词种质本体,象征逻辑,容器检索+本文受到国家基金会突出(60373084)《奉体经营机制》此外广东省物理学基会(04011304):《必须对付语义学Web的本体建造》的后退 U 占La J汽车邓奎基固奎佳明显的B 种质本体的引入是用来明智地使用种质和种质的比分。,是在附近的移民于的、对器和幼芽种质的划一象征。它是生物情报学中本体的人家要紧勤勉。,GO是勤勉本体作为明智地使用种质的根底。,像这样,它有可能勤勉象征逻辑举行成果。。在种质本体中添加越来越多的生物种质库,对其成果的探究正获得利益或财富越来越热。,如在种质本体中添加语义学)技术援助委U。,便于多种本体的集成;InstanceStore突出对种质本体创造了容器花色品种II“。 1本体 实体论可追踪的哲学版图。,它可以追溯到古希腊哲学家亚里士多德(公元前)。它在哲学上被使明确为成立地象征成立事物。,这执意在论。,对体系的解说或解说的成立在。,关怀的是我的成立真实的的抽象概念实质。。后头,跟随仿智的开展,仿智界抚养了人家新的使明确。。如今被遍及承担的本体使明确是Gruber在1993年推荐的“设想以前的的直言的的军旗阐明”的使明确。Fensel对大约使明确举行剖析后以为Ontology的设想包罗四个一组之物首要面 1.设想化(conceptua¨zation):成立世界的景象的抽象概念以前的; 2。使明确(不隐瞒的):设想及其衔接的严格使明确 3。拘泥形式(拘泥形式):严格的算学象征 4。共享(共享):成绩报告单在本体做成某事知是由。本体在知工程做成某事探究与勤勉、自然术语领会、知表现、软件工程版图越来越受到居民的珍视。。特别由于它集成在智能传达中。、传达获取、具有大型材工程等面的知,成有B。固然有多的不同的的方式来使明确实体论,但从外延上看,不同的探究者对本体的领会是一致的。,咱们以为本体是人家域(它可以是人家考虑到的域)。,它也可以是更广泛应用的向内不同的的提出(人)。、机具、软件体系私下的传染:扩散(会话)、互容易搬运、共享的语义学根底等,实体论对协商划一性的直言的解释。进一步说,,实体论试图的共识更多地是为,机具不领会用自然术语表现的语义学。,通常计算图表仅仅处置原文作为字母行举行处置。。本体排列的意思,更对考虑到音节的正式象征越过,更要紧的是有才能成果常作复合词的实体论。,因而扶助用户更明亮。、更手边的地会谈域传达。 2本体象征术语本体象征术语后退用户、拘泥形式的设想象征, 像这样应满意顺风的需要[ 9 ] / 使明确良好的语构CA well-defined 语构) / 使明确良好的语义学ca well.defined 语义学) 无效的成果后退(无效) reasoning 后退) 使充满表达才能(使充满) expressive 功率) 表达的宽裕的性(宽裕的性) 表达) 多的探究人员在这一版图很迅速的。,立即暴露了多种本体象征术语。,有 RDF和、OIL、DAML、oWL、KIF、SHOE、XOL、oCML、 器、CycL、隐约地出现等。将它们花色品种列举如下 网页被锐利的和啜饮、OIL、DAML、OWL、SHOE、 XOL。朝内的RDF和、OIL、DAML、OwL、液私下有紧密的接触人,它是W3C的本体术语堆栈的不同的军衔。,同时都是因为XML的 的。鞋是因为lrrml,这是HTML的研制。/和详细体系互相牵连的(根本只在互相牵连突出中勤勉的)有:器、 CycL、Loom。假定曾经是美国国家基准,但它并心不在焉在互联网网状物上收到广泛应用勤勉。,更依从的企业级作为兑换体式。 .2.1OWL[3,91 全名网状物 Ontology Language,它是语义学互联网网状物中本体象征术语的基准。。它是从人家结成的象征术语DAML OIL开展,朝内的 DAML的提议,是人美国、daml-ont,是人除英国外的欧洲国家本体象征术语的油。在 在W3C推荐的本体术语堆栈中,夜猫子在最下面。,图1-1。 The OntoIogy Language StaCk 图1-1本体术语栈计划不同的的查问OWL有三声望术语,象征列表相似地表1-1。 表三例1-1owl种子术语独特性术语象征里 oWLLite 用于只试图人家花色品种后退根底,只容许基级和简略属性约束的用户。0或1。 oWLDL 后退那个查问在成果体系上进行类的用户,在这里的人家子类推,相近成果体系可以确保体系的优秀的性和可。它包罗OWL术语的人家示例。。个人财产约束,但它可以禁闭考虑到的约束条件。。 oWLFuU 后退那个查问在心不在焉计算确保的人家类可以被同时表达语构自在的RDF上举行最大水平为多的人品的人家集中表达的用户。它容许本体做成某事人家和大约集中做成某事人家被预使明确(RDF)、难词汇编人品。在表中添加难词汇编表,因而一些成果软件都不克不及后退OWL 个人财产的全

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